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连作或与茄科作物套种使毒源增多,发病率和发病程度明显增加。不卫生栽培是造成流行的重要原因,在病、健株间往来触摸,施用未腐熟有机肥,培带有病毒的土壤都可加重病毒传染。土壤板结,气候干旱,田间线虫为害较重的地块发病重。
主要侵染源是被烟草花叶病毒侵染后的种子、带毒叶片等。烟株苗期抵抗烟草花叶病的能力弱,易患病。主要发生阶段是苗期至现蕾期,此期的温湿度适于病毒的流行和扩散。